toc總有機碳分析的主要特征
中心是一個集儀器設備的使用、方法開發、技術服務于一體的平臺,一方面支撐科學研究順利實施,另外一方面中心本身也是新技術新方法的“搖籃”。所以,中心提出了以“出”技術“出”方法,來促進科研的“出”人才“出”成果。從一個數據來看,2014年到2017年,中心的儀器設備使用機時每年以將近2萬個小時增長,使用率也以30%左右的比例逐年穩步提高。在這樣的技術支撐下,中心的用戶取得了非常好的、突破性的科研成果。從生化與細胞所本身來講,7年間有6項成果入選了中國科學十大進展;簡單統計,自2000年至2017年,研究所所發SCI論文大概有1000多篇,其中2017年更是“井噴式”發展,發表SCI論文近150篇。
研究所在中科院的支持下通過功能開發項目資助的方式來提升平臺的專業技術水平。在幾位老師介紹中,toc總有機碳分析讓編者印象深刻的有兩個項目,分別是2015-2016年的“提高高壓冷凍及冷凍替代技術電鏡制樣成功率的開發”項目和2016-2017年的“液體工作站用于自動化的二代測序文庫構建的功能開發”項目。
高壓冷凍制樣是國際前沿的技術,toc總有機碳分析不過其運行消耗非常大,一次實驗就需要幾百升液氮,樣品的成功率卻又很低,使得大部分人并不首選去做這個實驗。但是,這個實驗的好處也很明顯,即在瞬間超過冰點-190多度的溫度、高壓狀態下,能夠“高保真”的保持生物樣品的超微結構和活性。“平臺2011年建立電鏡分析系統時,也買了高壓冷凍儀和冷凍替代儀,那么,我們也就想一定要把方法建立起來。”邊瑋介紹到,“這個過程中我們不斷摸索,如根據儀器、樣品的特色,我們不斷自創小設備、改進技術方法等。該項目完成之后制樣成功率提高了三倍左右。”
對于自動化液體工作站項目,陳銘介紹到,最近兩年單細胞生物學特別熱門,經常會有非常好的文章發表。toc總有機碳分析但是在它的研究過程中經常會遇到一些問題,如現有的高通量測序的商業化設備可以對單細胞做一些特性、基因表達的鑒定,但它需要做到至少幾萬個細胞的規模,并且也只能提供一些通用的解決方案。實際上,如今有很多研究工作研究的細胞數量特別少,也就是說用常規設備是沒法做的。另外,如在腫瘤臨床樣本研究時還需要獲得細胞的空間等信息。針對這些需求,陳銘他們采用了一些不同的方式,如利用流式分選把相同的細胞分開;利用激光顯示切割的方式把腫瘤組織上的、明確的細胞挑出來;通過在硬件、軟件上做些實驗條件的優化,實現了自動化和單細胞測序建庫的銜接。之前,手工去做的話,需要兩個人四天才能完成一塊96孔板細胞的實驗操作,而在自動化工作站上去做的話,只要16個小時就可以做完,而且成功率大幅提高,高達95%以上。
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